Posgrado en Bioinformática: herramientas computacionales en informática médica, ciencias ómicas y diseño de fármacos
Plan de estudios

1. Informática médica

• Los datos masivos (Big-data) en la investigación biomédica y en la atención sanitaria. Datos médicos de carácter personal. La anonimización de los datos. Legislación en protección de datos
• Tipos de datos biomédicas. Bases de datos de artículos de científicos
• Análisis de datos: métodos estadísticos. El entorno de software R. Análisis de datos con R

2. Herramientas informáticas en investigación biomédica y atención sanitaria:

• Cloud computing. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) y otros
• Bases de datos de uso habitual en informática médica. PharmGKB, ClinVar-NCBI, OMIM, BioMart, PDB y otros
• Grabación de resultados y elaboración de informes

3. Biomoléculas y ciencias ómicas:

• Biomoléculas: desde el ADN a la síntesis de proteínas. Estructura del ADN. Los nucleótidos. Las proteínas. Los aminoácidos. Estructura de las proteínas. Transcripción del ADN. El ARN. Síntesis de proteínas
• Técnicas de secuenciación del ADN. Comparación de secuencias. Importancia en el estudio del genoma
• Ciencias ómicas. Genómica. Proteómica y metabolómica. Epigenómica. Interactómica y biología de sistemas. Otras ciencias ómicas. Aplicaciones
• Sectores de aplicación en el ámbito biomédico y agroalimentario

4. Herramientas informáticas en las ciencias ómicas:

• Herramientas de uso habitual en genómica. Manipulación de secuencias. Alineación. Acoplamiento de genomas. Anotación de genes. SAMtools, Galaxy y otros
• Repositorio de herramientas y aplicaciones de uso habitual en ciencias ómicas. Introducción a Bioconductor
• Aplicación de Bioconductor en las ciencias ómicas: en transcriptómica y en epigenómica
• Grabación de resultados y elaboración de informes

5. Los fármacos y los receptores:

• Los fármacos. Finalidades. Formas farmacéuticas y medicamentos
• Biodisponibilidad y farmacocinética. ADME
• Estructura de las proteínas
• Receptores. Interacción fármaco-receptor: agonistas, antagonistas, etc
• Estructura espacial de las moléculas. Modelos 3D moleculares. Enlaces intermoleculares. Grupos funcionales

6. Herramientas informáticas en el diseño de nuevos fármacos:

• Bases de datos de estructuras químicas
• Obtención de datos. Filtrado. Métodos de búsqueda
• Cribado virtual 2D (virtual screening)
• Herramientas para la búsqueda y el diseño de farmacóforos
• Herramientas para el acoplamiento molecular (docking): Autodock y AutoGrid
• Herramientas para simulación de dinámica molecular: Gromacs, Amber y CHARMM
• Herramientas para el modelado por homología: Swiss-Model
• Grabación de resultados y elaboración de informes