Postgrau en Bioinformàtica: Eines Computacionals en Informàtica Mèdica, Ciències Òmiques i Disseny de Fàrmacs
Pla d’estudis

1. Informàtica mèdica

• Les dades massives (Big-Data) en la investigació biomèdica i en l’atenció sanitària. Dades mèdiques de caràcter personal. L’anonimització de les dades. Legislació en protecció de dades
• Tipus de dades biomèdiques. Bases de dades d’articles científics
• Anàlisi de dades: mètodes estadístics. L’entorn de software R. Anàlisi de dades amb R.

2. Eines informàtiques en investigació biomèdica i atenció sanitària

• Cloud computing. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) i altres
• Bases de dades d’ús habitual en informàtica mèdica. PharmGKB, ClinVar-NCBI, OMIM, BioMart, PDB i altres
• Gravació de resultats i elaboració d’informes

3. Biomolècules i ciències òmiques

• Biomolècules: des de l’ADN a la síntesi de proteïnes. Estructura de l’ADN. Els nucleòtids. Les proteïnes. Els aminoàcids. Estructura de les proteïnes. Transcripció de l’ADN. L’ARN. Síntesi de proteïnes.
• Tècniques de seqüenciació de l’ADN. Comparació de seqüències. Importància en l’estudi del genoma
• Ciències òmiques. Genòmica. Proteòmica i metabolòmica. Epigenòmica. Interactòmica i biologia de sistemes. Altres ciències òmiques. Aplicacions
• Sectors d’aplicació en l’àmbit biomèdic i agroalimentari

4. Eines informàtiques de les ciències òmiques

• Eines d’ús habitual en genòmica. Manipulació de seqüències. Alineació. Acoblament de genomes. Anotació de gens. SAMtools, Galaxy i altres
• Repositori d’eines i aplicacions d’ús habitual en ciències òmiques. Introducció a Bioconductor
• Aplicació de Bioconductor en les ciències òmiques: en transcriptòmica i en epigenòmica
• Gravació de resultats i elaboració d’informes

5. Els fàrmacs i els receptors:

• Els fàrmacs. Finalitats. Formes farmacèutiques i medicaments
• Biodisponibilitat i farmacocinètica. ADME
• Estructura de les proteïnes
• Receptors. Interacció fàrmac-receptor: agonistes, antagonistes, etc
• Estructura espacial de les molècules. Models 3D moleculars. Enllaços intermoleculars. Grups funcionals

6. Eines informàtiques en el disseny de nous fàrmacs:

• Bases de dades d’estructures químiques
• Obtenció de dades. Filtratge. Mètodes de cerca
• Garbellat virtual 2D (virtual screening)
• Eines per la cerca i el disseny de farmacòfors
• Eines per l’acoblament molecular (docking): Autodock i AutoGrid
• Eines per a simulació de dinàmica molecular: Gromacs, Amber i CHARMM
• Eines per al modelat per homologia: Swiss-Model
• Gravació de resultats i elaboració d’informes