- Informació
1. Informàtica mèdica
- Les dades massives (Big-Data) en la investigació biomèdica i en l’atenció sanitària. Dades mèdiques de caràcter personal. L’anonimització de les dades. Legislació en protecció de dades
- Tipus de dades biomèdiques. Bases de dades d’articles científics
- Anàlisi de dades: mètodes estadístics. L’entorn de software R. Anàlisi de dades amb R.
2. Eines informàtiques en investigació biomèdica i atenció sanitària
- Cloud computing. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) i altres
- Bases de dades d’ús habitual en informàtica mèdica. PharmGKB, ClinVar-NCBI, OMIM, BioMart, PDB i altres
- Gravació de resultats i elaboració d’informes
3. Biomolècules i ciències òmiques
- Biomolècules: des de l’ADN a la síntesi de proteïnes. Estructura de l’ADN. Els nucleòtids. Les proteïnes. Els aminoàcids. Estructura de les proteïnes. Transcripció de l’ADN. L’ARN. Síntesi de proteïnes.
- Tècniques de seqüenciació de l’ADN. Comparació de seqüències. Importància en l’estudi del genoma
- Ciències òmiques. Genòmica. Proteòmica i metabolòmica. Epigenòmica. Interactòmica i biologia de sistemes. Altres ciències òmiques. Aplicacions
- Sectors d’aplicació en l’àmbit biomèdic i agroalimentari
4. Eines informàtiques de les ciències òmiques
- Eines d’ús habitual en genòmica. Manipulació de seqüències. Alineació. Acoblament de genomes. Anotació de gens. SAMtools, Galaxy i altres
- Repositori d’eines i aplicacions d’ús habitual en ciències òmiques. Introducció a Bioconductor
- Aplicació de Bioconductor en les ciències òmiques: en transcriptòmica i en epigenòmica
- Gravació de resultats i elaboració d’informes
5. Els fàrmacs i els receptors:
- Els fàrmacs. Finalitats. Formes farmacèutiques i medicaments
- Biodisponibilitat i farmacocinètica. ADME
- Estructura de les proteïnes
- Receptors. Interacció fàrmac-receptor: agonistes, antagonistes, etc
- Estructura espacial de les molècules. Models 3D moleculars. Enllaços intermoleculars. Grups funcionals
6. Eines informàtiques en el disseny de nous fàrmacs:
- Bases de dades d’estructures químiques
- Obtenció de dades. Filtratge. Mètodes de cerca
- Garbellat virtual 2D (virtual screening)
- Eines per la cerca i el disseny de farmacòfors
- Eines per l’acoblament molecular (docking): Autodock i AutoGrid
- Eines per a simulació de dinàmica molecular: Gromacs, Amber i CHARMM
- Eines per al modelat per homologia: Swiss-Model
- Gravació de resultats i elaboració d’informes
- Informació
Pendent
de determinar